3Dで探る 生命の形と機能

綜合画像研究支援(編)

綜合画像研究支援(編)

定価 3,520 円(本体 3,200 円+税)

B5判/120ページ
刊行日:2013年10月20日
ISBN:978-4-254-17157-0 C3045

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内容紹介

バイオイメージングにより生命機能の理解は長足の進歩を遂げた。本書は豊富な図・写真を活用して詳述。〔内容〕3D再構築法と可視化の基礎/3Dイメージング/胚や組織の3D再構築法/電子線トモグラフィ法/各種顕微鏡による3D再構築法。

編集部から

目次

はじめに:急速に進化する3Dワールド[牛木辰男]
1.3D再構築と仮想立体視の基礎[高沖英二]
 1.1 3D再構築の基礎
  1.1.1 多面体(ポリゴン)モデルとポリゴンレンダリング
  1.1.2 ボクセルモデルとボリュームレンダリング
  1.1.3 3D再構築とS3Dの実例
 1.2 仮想立体視の基礎
  1.2.1 2つの投影法
  1.2.2 S3Dの幾何学
  1.2.3 S3D撮影法
  1.2.4 S3Dの観察位置と見かけの歪
  1.2.5 大型スクリーンにおけるS3D
  1.2.6 S3D上映における注意点
  1.2.7 まとめ
2.3Dイメージングの基礎[伊藤広]
 2.1 立体視の基礎
  2.1.1 3Dとは
  2.1.2 ヒトの視覚と3D
  2.1.3 「3D」の定義
 2.2 3Dイメージングの原理
  2.2.1 視差情報による3Dイメージング
  2.2.2 2眼式と多眼式
  2.2.3 交差法と平行法
 2.3 3Dイメージングのための表示法
  2.3.1 観視方式
  2.3.2 混在表示方式
 2.4 各種3D表示方式の比較
  2.4.1 3D映画方式の比較
  2.4.2 3D-TV方式の比較
  2.4.3 3D液晶モニター方式の比較
  2.4.4 その他の方式
 2.5 まとめ
3.実体顕微鏡の3Dイメージング法[高沖英二]
 3.1 双眼実体顕微鏡の利用と種類
  3.1.1 グリノー式実体顕微鏡
  3.1.2 ガリレイ式実体顕微鏡
 3.2 双眼実体顕微鏡を用いた3D動画記録の方法
  3.2.1 視差の問題
  3.2.2 高速カメラによる3D動画撮影
  3.2.3 通常速度の動画撮影
  3.2.4 安価な3D動画撮影システムの可能性
  3.2.5 3D動画の編集と上映
4.連続切片を用いた胚や組織の立体再構築[駒崎伸二・亀澤一・猪股玲子]
 4.1 連続写真画像に含まれる構造の輪郭をトレースしたデータから立体再構築する方法
  4.1.1 使用するソフト
  4.1.2 作業の実際
 4.2 連続切片の写真から直接に立体モデルを作製するボリュームレンダリング法
  4.2.1 使用するソフト
  4.2.2 作業の実際
  4.2.3 ボリュームレンダリングされた立体モデルを観察するためのソフト(ビュアー)
 4.3 ボリュームレンダリング法で作製された立体モデルの観察モード
  4.3.1 擬似カラーや影づけなどによる立体モデルや断面構造の強調
  4.3.2 立体モデルのバーチャルな微小解剖
  4.3.3 様々なモードによる立体モデルの表現法
  4.3.4 高精細な立体モデルの作製
  4.3.5 他の方法との組合せ
 4.4 まとめ
5.電子線トモグラフィー法[光岡薫・峰雪芳宣・臼倉治郎]
 Ⅰ.電子線トモグラフィーの原理と表示[光岡薫]
  5.1 電子線トモグラフィーの原理
  5.2 電子線トモグラフィーの表示形式
 Ⅱ.電子線トモグラフィーと植物の細胞枠組み構造[峰雪芳宣]
  5.3 電子線トモグラフィーによる植物細胞の3D解析
   5.3.1 植物の細胞構築と細胞分裂面挿入予定位置
   5.3.2 樹脂包埋植物組織の2軸電子線トモグラフィー
   5.3.3 試料の調製
   5.3.4 画像取得とトモグラム作製
   5.3.5 画像解析:微小管
   5.3.6 画像解析:膜システム
   5.3.7 今後の展望
 Ⅲ.電子線トモグラフィーと細胞骨格の空間構造[臼倉治郎]
  5.4 トモグラフィーとトポグラフィー
  5.5 分子レベルの立体構造解析
  5.6 アクチン細胞骨格の構造解析
6.走査型電子顕微鏡による3D技法[於保英作・牛木辰男・伊東祐輔・小竹航・山澤雄・岩田太]
 Ⅰ.走査型電子顕微鏡像の3D再構築と計測[於保英作]
  6.1 試料表面構造の3D観察法
   6.1.1 視差情報を用いたステレオ観察法
   6.1.2 対物レンズ励磁電流値から高さを測定する方法
   6.1.3 反射電子の着信号を用いて3D像再構築を行う複数検出器法
  6.2 4分割半導体反射電子検出器による3D像再構築の原理
   6.2.1 正規化反射電子差信号の利用
   6.2.2 正規化反射電子差信号を試料表面構造の傾斜角度θに変換する実験式
   6.2.3 複数検出器法における注意点
   6.2.4 傾斜角度情報から高さ情報への変換
   6.2.5 3D像再構築手順の整理
  6.3 3D像再構築の実際
   6.3.1 3D像再構築結果の確認
   6.3.2 低加速電圧反射電子像の必要性
   6.3.3 3D再構築像へのSEM像コントラストの貼付け
   6.3.4 3D再構築像を用いた試料表面構造の凹凸判断
   6.3.5 高倍率観察時における試料表面構造の高さ計測
   6.3.6 3D像再構築法とユーセントリック試料傾斜ステージを組み合わせた3D観察
   6.3.7 まとめ
 Ⅱ.走査型電子顕微鏡のステレオ3Dイメージング
  6.4 SEMの原理[牛木辰男]
  6.5 サンプルチルト法によるステレオ3Dイメージング[牛木辰男]
  6.6 ビームチルト法によるステレオ3Dイメージング
   6.6.1 ビームチルト3D-SEMの原理[伊東祐輔・小竹航・山澤雄]
   6.6.2 ステレオ3Dイメージングとマニピュレーション[岩田太]
7.走査型プローブ顕微鏡による3D表示[牛木辰男]
 7.1 AFMの原理
 7.2 AFMの特徴と3D画像
 7.3 AFMのバイオ3Dイメージング例
 7.4 AFMのイメージング以外の利用法
 7.5 AFM以外のSPMのバイオ応用
あとがき
索引
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