1.　生態系の見方とシミュレーション
　1.1　生態系とは
　1.2　生態学の数理的解析
　1.3　数理生態学のここしばらくの進歩
　1.4　生態モデリング
　1.5　よいモデルとは何か
　1.6　3つの領域の統合に向けて
2.　生態系のさまざまなとらえ方
　2.1　水域生態系のコンパートメントモデル
　　コンパートメントモデルとは／水系生態系の機能と構造／エネルギーモデル／物質収支モデル／流体輸送・物質負荷モデル／水理現象と水質の関係性／水質と生態系の関係性／モデル構造による精度と計算速度／係数値の推定と予測精度／モデリングの将来
　2.2　生物集団の絶滅リスク
　　野生生物の絶滅プロセス／人間活動がもたらす絶滅リスク／絶滅のリスクを推定する／カノニカルモデル：安定集団の存続時間／DDTの生態リスク評価:セグロカモメ集団の絶滅リスクの試算／1つの集団の喪失を種全体の喪失とどのように結び付けるか／リスクを定量化することで管理ができる
　2.3　生物資源の持続的管理
　　管理目標と数理モデル／浮魚類の魚種交替現象／漁業生態系モデルとEcopath／Ecopathの生態学的アプローチ／Ecosimと資源変動のシミュレーション／生態系の間接効果／構造をもつ個体数変動の数理モデル／個体群管理とリスク評価
3.　陸上生態系のモデル化
　3.1　森林の木々の動態モデル
　　木,森林,そしてモデル／ギャップモデルJABOWA／連続空間モデルSORTIE／サイズ構造モデル／森林動態モデルの検証／これからの森林動態モデル
　3.2　昆虫の発生パターンのモデル:都市緑地の害虫アメリカシロヒトリを例に
　　 目的／アメリカシロヒトリの生活史／記述力の高い個体数動態モデルの重要性／昆虫の成長と休眠／モデルの定式化／シミュレーション解析の結果と考察
　3.3　野生動物集団のダイナミックス:個体群存続可能性分析
　　PVAの構造／危機に頻する小個体群のパラダイム／PVAにおけるモデル／シミュレーションにおいて考慮すべきその他の要因／シミュレーションの実行とリスク評価／感度分析／空間的広がりを想定したPVA／メタ個体群への拡張／PVAの限界
4.　水圏生態系のモデル
　4.1　河川における魚類の生息地
　　生息地の空間規模と攪乱の頻度／魚類の生息地として望ましい条件／多様度指数／魚類の生息地評価
　4.2　魚類の選好性モデル
　　なぜ魚類の選好性を扱うことが必要か／選好性のモデル化／魚の泳がせ方／魚類の選好性モデルの例／今後の展望
　4.3　海域の生態系予測モデル
　　海のモデル／海のモデルの状態変数／物理のモデル／いくつかの研究の紹介／このような海洋生態系モデルで研究しようと思っていること
　4.4　日射による溶存酸素濃度の影響
　　解析対象水域／博多湾への流入負荷量／予測モデル／確率モデルを用いた気象条件の生成／予測結果
5.　おわりに
6.　索　　引